Evangelion Production Model-03

Comme pour toutes les Evangelions, à part l'Evangelion Unité-01, la méthode de création de l'Unité-03 demeure inconnue. Elle a été conçue au sein de la NERV-02, située au Nevada aux États-Unis, en parallèle de sa sœur l'Evangelion Unité-04 dans les laboratoires de la NERV-01. D'après Misato Katsuragi, le gouvernement américain a insisté auprès de la NERV pour que la construction des Eva-03 et 04 soit réalisée aux USA. Il s'agit du deuxième Modèle de Production, succédant à l'Evangelion Unité-02 conçue en Allemagne. Il est très probable que l'Eva-03 ait subi une Expérience de Contact, au même titre que l'Eva-01 et l'Eva-02. Cependant, aucune information n'est divulguée à ce sujet, que ce soit la date de l'expérience, son sujet de test, ou même si elle a véritablement eu lieu.

En 2015, une expérience est menée sur l'Eva-04 pour mettre au point une nouvelle source d'alimentation inspirée du Moteur S². Cette expérience se solde par un échec cuisant, et suite à cet incident, les laboratoires ainsi que l'Eva disparaissent dans une Mer de Dirac. Face à cette catastrophe, le gouvernement étasunien demande que l'Unité-03 soit transférée au Quartier Général de la NERV au Japon. L'Eva-03 est alors transportée par voie aérienne, traversant ainsi l'océan Pacifique. Cependant, au cours du voyage, elle est accidentellement infectée par un ange microscopique dissimulé dans un cumulonimbus : Bardiel. La NERV ne détecte pas l'infection et conduit l'Eva à son point de rendez-vous à Matsuhiro. Là-bas, elle doit réaliser un premier test d'activation avec Tōji Suzuhara, son pilote tout juste désigné. Ce test est fait en présence de Misato et de Ritsuko Akagi.

Alors que tout semble se passer convenablement, Bardiel manifeste sa présence au moment de l'activation de l'Eva. L'Ange prend le contrôle de l'Evangelion et provoque une détonation qui souffle les installations de la NERV et engendre d'importants dégâts matériels et de nombreuses blessures parmi le personnel. Le QG de la NERV est rapidement informé de l'incident. Le Commandant Gendō Ikari ordonne l'éjection de l'Entry Plug de l'Eva-03, mais une sorte de substance l'en empêche. Face à cet échec, l'Eva-03 est définitivement abandonnée et désormais considérée comme un Ange. L'Evangelion Unité-00, l'Unité-01 et l'Unité-02 sont déployées pour le neutraliser. Rei Ayanami et Asuka Langley Sōryū échouent à cette mission, laissant Shinji Ikari seul. Il refuse de se battre craignant de blesser le pilote de l'Eva-03, mais le Commandant ordonne l'activation du Dummy System de l'Eva-01. Dans une rage incontrôlable, l'Unité-01 s'attaque violemment à Bardiel en déchiquetant son corps. Après plusieurs minutes de massacre, Bardiel et l'Eva-03 sont définitivement morts. Tōji est grièvement blessé et doit subir l'amputation de sa jambe gauche à la suite de cet incident.